Considerado um dos maiores cemitérios do Brasil, o Cemitério São Francisco Xavier faz parte dos quatro cemitérios que compõem o conjunto conhecido como Cemitério do Caju, localizado no bairro Caju.
Até 1851, o cemitério conhecido como Campo da Misericórdia realizava somente sepultamentos de escravos. Em outubro do mesmo ano o Cemitério São Francisco Xavier foi construído onde estava localizado o Campo da Misericórdia e entrega à administração da Casa de Misericórdia.
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O primeiro sepultamento no novo cemitério ocorreu em dezembro 1851, uma africana livre pertencente a Casa de Correção.
O cemitério concede sepulturas temporárias pelo período de sete anos e sepulturas perpétuas. Além disso, conta com capelas e mausoléus artísticos e detalhados.
O principal túmulo do cemitério é o ossuário Mausoléu dos Integralistas, onde estão os restos mortais dos militantes intregralistas de 1935.